Главная страница
Главная страница
Диссертационные советы
Текущая работа диссоветов
Архив
Справочная информация по вопросам научной аттестации
Ф.И.О. Шимолина Любовь Евгеньевна
Диссертация Кандидатская диссертация на тему: Исследование микровязкости цитоплазматической мембраны опухолевых клеток при химиотерапии с помощью флуоресцентной время-разрешѐнной микроскопии (4.13 Мб, загрузить)
Диссертационный совет 24.2.340.06
Научная специальность 1.5.2. - Биофизика (биологические науки)
Дата защиты 20.10.2022
Статус Присвоена степень кандидата наук
Автореферат Загрузить
Отзывы:
  1. Борщевский Валентин Иванович, к.ф.-м.н., зам. директора Центра исследований молекулярных механизмов старения и возрастных заболеваний ФГАОУ ВО "Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет)" - отзыв
  2. Гончарова Анна Сергеевна, к.б.н., зав. Испытательным лабораторным центром ФГБУ "Национальный медицинский исследовательский центр онкологии" Минздрава России - отзыв
  3. Жердева Виктория Вячеславовна, к.б.н., с.н.с., зам. заведующего лабораторией молекулярного имиджинга ФИЦ Биотехнологии РАН - отзыв
  4. Клапшина Лариса Григорьевна, к.х.н., руководитель группы "Хромофорные соединения для медицины", с.н.с. ФГБУН "Институт металлоорганической химии им. Г.А. Разуваева Российской академии наук" - отзыв
  5. Максимов Евгений Георгиевич, д.б.н., в.н.с. каф. биофизики, и.о. зав. межкафедральной лабораторией физико-химии биомембран Биологического факультета МГУ им. Ломоносова - отзыв
  6. Меерович Ирина Геннадьевна, к.х.н., научн. сотр. лаб. физической биохимии ФГБУН "Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" Российской академии наук", Институт биохимии им. А.Н. Баха - отзыв
  7. Тучин Валерий Викторович, д.ф.-м.н., проф., член-корр. РАН, зав. каф. оптики и биофотоники, директор Научного медицинского центра ФГБОУ ВО "Саратовский национальный исследовательский государственный университет имени Н.Г. Чернышевского" - отзыв
Объявление на сайте ВАК https://vak.minobrnauki.gov.ru/advert/100067743
Ведущая организация ФГАОУ ВО Первый Московский государственный медицинский университет имени И. М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации (Сеченовский университет) (отзыв)

Адрес: 119991, г. Москва, ул. Трубецкая, д. 8, стр. 2

Список основных публикаций работников ведущей организации по теме диссертации в рецензируемых научных изданиях за последние 5 лет:
1. Okkelman, I.A., Papkovsky, D.B., Dmitriev, R.I. Estimation of the Mitochondrial Membrane Potential Using Fluorescence Lifetime Imaging Microscopy. Cytometry Part A, 2020, 97(5), 471-482.
2. Tyurikova, O., Zheng, K., Nicholson, E., Timofeeva, Y., Semyanov, A., Volynski, K., Rusakov, D. Fluorescence lifetime imaging reveals regulation of presynaptic Ca2+ by glutamate uptake and mGluRs, but not somatic voltage in cortical neurons. Journal of Neurochemistry, 2021, 156(1), 48-58.
3. Okkelman, I.A., Neto, N., Papkovsky, D.B., Monaghan, M.G., Dmitriev, R.I. A deeper understanding of intestinal organoid metabolism revealed by combining fluorescence lifetime imaging microscopy (FLIM) and extracellular flux analyses. Redox Biology, 2020, 30,101420.
4. Nakhaei, P., Margiana, R., Bokov, D. O., Abdelbasset, W. K., Jadidi Kouhbanani, M. A., Varma, R. S., Marofi, F., Jarahian, M., & Beheshtkhoo, N. Liposomes: Structure, Biomedical Applications, and Stability Parameters With Emphasis on Cholesterol. Frontiers in bioengineering and biotechnology, 2021, 9, 705886.
5. Sukocheva O.A., Liu J., Neganova M.E., Beeraka N.M., Aleksandrova Y.R., Manogaran P., Grigorevskikh E.M., Chubarev V.N., Fan R. Perspectives of using microRNA-loaded nanocarriers for epigenetic reprogramming of drug resistant colorectal cancers. Semin Cancer Biol., 2022, S1044-579X(22)00123-7.
6. Rozenberg, J. M., Filkov, G. I., Trofimenko, A. V., Karpulevich, E. A., Parshin, V. D., Royuk, V. V., Sekacheva, M. I., & Durymanov, M. O. (2021). Biomedical Applications of Non-Small Cell Lung Cancer Spheroids. Frontiers in oncology, 11, 791069.
7. Beatty A., Singh T., Tyurina Y.Y., Tyurin V.A., Samovich S., Nicolas E., Maslar K., Zhou Y., Cai K.Q., Tan Y., Doll S., Conrad M., Subramanian A., Bayır H., Kagan V.E., Rennefahrt U., Peterson J.R. Ferroptotic cell death triggered by conjugated linolenic acids is mediated by ACSL1. Nat Commun., 2021, 12(1), 2244.
8. Huldani H., Jasim S.A., Sergeenva K.N., Bokov D.O., Abdelbasset W.K., Turakulov R., Al-Gazally M.E., Ahmadzadeh B., Jawhar Z.H., Siahmansouri H. Mechanisms of cancer stem cells drug resistance and the pivotal role of HMGA2. Pathol Res Pract., 2022, 234, 153906.
9. Dallavalasa S., Beeraka N.M., Basavaraju C.G., Tulimilli S.V., Sadhu S.P., Rajesh K., Aliev G., Madhunapantula S.V. The Role of Tumor Associated Macrophages (TAMs) in Cancer Progression, Chemoresistance, Angiogenesis and Metastasis - Current Status. Curr Med Chem., 2021, 28(39), 8203-8236.
10. Rovnyagina N.R., Budylin G.S., Vainer Y.G., Tikhonova T.N., Vasin S.L., Yakovlev A.A., Kompanets V.O., Chekalin S.V., Priezzhev A.V., Shirshin E.A. Fluorescence Lifetime and Intensity of Thioflavin T as Reporters of Different Fibrillation Stages: Insights Obtained from Fluorescence Up-Conversion and Particle Size Distribution Measurements. Int J Mol Sci., 2020, 21(17), 6169.
11. Shlapakova T.I., Kostin R. K., Tyagunova E. E. Reactive Oxygen Species: Participation in Cellular Processes and Progression of Pathology. Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 2020, 46, No 5, 657-674.
12. Khan M.M., Madni A., Filipczak N., Pan J., Rehman M., Rai N., Attia S.A., Torchilin V.P. Folate targeted lipid chitosan hybrid nanoparticles for enhanced anti-tumor efficacy. Nanomedicine, 2020, 28, 102228.

Организации, где выполнялась диссертация ННГУ им. Н.И. Лобачевского
Место работы Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Приволжский исследовательский медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации
Научный руководитель Ширманова Марина Вадимовна, к.б.н., зав. научной лабораторией флюоресцентного биоимиджинга НИИ экспериментальной онкологии и биомедицинских технологий ПИМУ (отзыв)
Оппоненты
  1. Васютинский Олег Святославович, доктор физико-математических наук, главный научный сотрудник лаборатории газодинамических явлений Физико-технического института им. А.Ф. Иоффе РАН (отзыв)

    Наименования отрасли науки, научной специальности, по которым оппонентом защищена диссертация:
    01.04.08 - физика и химия плазмы

    Список основных публикаций официального оппонента по теме диссертации в рецензируемых научных изданиях за последние 5 лет:
    1. Two-Photon Excited Fluorescence Dynamics in Enzyme-Bound NADH: The Heterogeneity of Fluorescence Decay Times and Anisotropic Relaxation. Gorbunova, I.A., Sasin, M.E., Golyshev, D.P., Semenov, A.A., Smolin, A.G.Beltukov, Y.M., Vasyutinskii, O.S. 2021, Journal of Physical Chemistry B, 125(34), 9692-9707.
    2. Significant difference in response of malignant tumor cells of individual patients to photodynamic treatment as revealed by digital holographic microscopy. Zhikhoreva A.A., Belashov A.V., Danilova A.B., Avdonkina N.A., Baldueva I.A., Gelfond M.L., Nekhaeva T.L., Semenova I.V., Vasyutinskii O.S. Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology, 2021, 221,112235.
    3. Anisotropic relaxation in NADH excited states studied by polarization-modulation pump–probe transient spectroscopy. Gorbunova, I. A., Sasin, M. E., Beltukov, Y. M., Semenov, A. A., Vasyutinskii, O. S. Physical Chemistry Chemical Physics, 2020, 22(32), 18155–18168.
    4. Singlet oxygen generation in aerosol jet and on biological surfaces. Zhikhoreva A.A., Belashov A.V., Ignatov E.S., Gelfond M.L., Semenova I.V., Vasyutinskii O.S. Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology, 2022, 188, 112395.
    5. Relaxation dynamics of alkyl derivatives of fluorescein MitoFluo and C8-Fl in solutions with liposomes. Beltukova D.M., Belik V.P., Semak B.V., Semenova I.V., Smolin A. G., Vasyutinskii O.S. Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, 2021, 263, 120145.
    6. Quantitative assessment of changes in cellular morphology at photodynamic treatment in vitro by means of digital holographic microscopy. Belashov A.V., Zhikhoreva A.A., Belyaeva T.N., Nikolsky N.N., Semenova I.V., Kornilova E.S., Vasyutinskii O.S. Biomed Opt Express, 2019, 10(10), 4975-4986.
    7. Machine Learning Assisted Classification of Cell Lines and Cell States on Quantitative Phase Images. Belashov, A.V., Zhikhoreva, A.A., Belyaeva, T.N., Salova, A.V., Kornilova, E.S., Semenova, I.V., Vasyutinskii, O.S. Cells, 2021, 10, 2587.
    8. Investigation of Radachlorin accumulation in 3T3 cells by fluorescence microscopy and holographic tomography. Zhikhoreva A. A., Belashov A. V., Belyaeva T. N., Kornilova E. S., Semenova I. V., Vasyutinskii O. S. in European Conferences on Biomedical Optics 2021 (ECBO), OSA Technical Digest (Optica Publishing Group, 2021), EW4A.19.
    9. The role of microenvironment in the mechanisms of fluorescence decay in free and protein-bound NADH. Gorbunova I. A., Sasin M. E., Golyshev D. P., Krasnopevtceva M. K., Smolin A. G., Beltukov Y. M., Vasyutinskii O. S. Proc. SPIE 11900, Optics in Health Care and Biomedical Optics XI, 2020, 119003G.
    10. Two-Photon Excited Fluorescence Dynamics in NADH in Water-Methanol Solutions: The Role of Conformation States. Gorbunova I.A., Sasin M.E., Rubayo-Soneira J., Smolin A.G., Vasyutinskii O.S. J Phys Chem B., 2020, 124(47), 10682-10697.
    11. Decay Times and Anisotropy in Polarized Fluorescence of Flavin Adenine Dinucleotide Determined with Subnanosecond Resolution. Krasnopevtseva, M.K., Belik, V.P., Semenova, I.V. et al. Tech. Phys. Lett., 2020, 46, 614–616.
    12. In vitro monitoring of photoinduced necrosis in HeLa cells using digital holographic microscopy and machine learning. Belashov A.V., Zhikhoreva A.A., Belyaeva T.N., Kornilova E.S., Salova A.V., Semenova I.V., Vasyutinskii O.S. J Opt Soc Am A Opt Image Sci Vis., 2020, 37(2), 346-352.
    13. Morphological Changes in Malignant Tumor Cells at Photodynamic Treatment Assessed by Digital Holographic Microscopy. Zhikhoreva, A.A., Belashov, A.V., Gorbenko, D.A. et al. Russ. J. Phys. Chem. B, 2019, 13, 394–400.
    14. Polarized Fluorescence in NADH Two-Photon Excited by Femtosecond Laser Pulses in the Wavelength Range of 720–780 nm. Sasin, M. E., Gorbunova, I. A., Bezverkhnii, N. O., Beltukov, Y. M., Vasyutinskii, O. S., Rubayo-Soneira, J. Technical Physics Letters, 2019, 45(7), 672-674.

  2. Котова Елена Аврамовна, кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник отдела фотосинтеза и флуоресцентных методов исследований Научно-исследовательского института физико-химической биологии имени А.Н. Белозерского МГУ имени М.В. Ломоносова (отзыв)

    Наименования отрасли науки, научной специальности, по которым оппонентом защищена диссертация:
    03.01.02 - биофизика

    Список основных публикаций официального оппонента по теме диссертации в рецензируемых научных изданиях за последние 5 лет:
    1. Chertkova RV, Firsov AM, Brazhe NA, Nikelshparg EI, Bochkova ZV, Bryantseva TV, Semenova MA, Baizhumanov AA, Kotova EA, Kirpichnikov MP, Maksimov GV, Antonenko YN, Dolgikh DA. Multiple Mutations in the Non-Ordered Red Ω-Loop Enhance the Membrane-Permeabilizing and Peroxidase-like Activity of Cytochrome c. Biomolecules. 2022 May 4;12(5):665.
    2. Firsov AM, Franco MSF, Chistyakov DV, Goriainov SV, Sergeeva MG, Kotova EA, Fomich MA, Bekish AV, Sharko OL, Shmanai VV, Itri R, Baptista MS, Antonenko YN, Shchepinov MS. Deuterated polyunsaturated fatty acids inhibit photoirradiation-induced lipid peroxidation in lipid bilayers. J Photochem Photobiol B. 2022 Apr;229:112425.
    3. Rokitskaya TI, Kotova EA, Luzhkov VB, Kirsanov RS, Aleksandrova EV, Korshunova GA, Tashlitsky VN, Antonenko YN. Lipophilic ion aromaticity is not important for permeability across lipid membranes. Biochim Biophys Acta Biomembr. 2021 Jan 1;1863(1):183483.
    4. Kondrashov OV, Rokitskaya TI, Batishchev OV, Kotova EA, Antonenko YN, Akimov SA. Peptide-induced membrane elastic deformations decelerate gramicidin dimer-monomer equilibration. Biophysical Journal. 2021; 120(23): 5309-5321.
    5. Iaubasarova IR, Khailova LS, Firsov AM, Grivennikova VG, Kirsanov RS, Korshunova GA, Kotova EA, Antonenko YN. The mitochondria-targeted derivative of the classical uncoupler of oxidative phosphorylation carbonyl cyanide m-chlorophenylhydrazone is an effective mitochondrial recoupler. PLoS One. 2020 Dec 30;15(12):e0244499.
    6. Rokitskaya TI, Kotova EA, Antonenko YN. Anomalous potentials on bilayer lipid membranes in the presence of usnic acid: Markin-Sokolov versus Nernst-Donnan equilibrium. Bioelectrochemistry. 2021; 141:107825.
    7. Firsov AM, Fomich MA, Bekish AV, Sharko OL, Kotova EA, Saal HJ, Vidovic D, Shmanai VV, Pratt DA, Antonenko YN, Shchepinov MS. Threshold protective effect of deuterated polyunsaturated fatty acids on peroxidation of lipid bilayers. FEBS J. 2019 Jun;286(11):2099-2117.
    8. Rokitskaya TI, Terekhova NV, Khailova LS, Kotova EA, Plotnikov EY, Zorov DB, Tatarinov DA, Antonenko YN. Zwitterionic Protonophore Derived from 2-(2-Hydroxyaryl)alkenylphosphonium as an Uncoupler of Oxidative Phosphorylation. Bioconjug Chem. 2019 Sep 18;30(9):2435-2443.
    9. Chertkova RV, Firsov AM, Kotova EA, Gusev ID, Dolgikh DA, Kirpichnikov MP, Antonenko YN. Lysine 72 substitutions differently affect lipid membrane permeabilizing and proapoptotic activities of horse heart cytochrome c. Biochem Biophys Res Commun. 2021 Apr 9;548:74-77.
    10. Popova LB, Kamysheva AL, Rokitskaya TI, Korshunova GA, Kirsanov RS, Kotova EA, Antonenko YN. Protonophoric and Photodynamic Effects of Fluorescein Decyl(triphenyl)phosphonium Ester on the Electrical Activity of Pond Snail Neurons. Biochemistry (Moscow). 2019; 84(10):1151-1165.
    11. Chelombitko MA, Firsov AM, Kotova EA, Rokitskaya TI, Khailova LS, Popova LB, Chernyak BV, Antonenko YN. Usnic acid as calcium ionophore and mast cells stimulator. Biochim Biophys Acta Biomembr. 2020 Sep 1;1862(9):183303.
    12. Khailova LS, Vygodina TV, Lomakina GY, Kotova EA, Antonenko YN. Bicarbonate suppresses mitochondrial membrane depolarization induced by conventional uncouplers. Biochem Biophys Res Commun. 2020 Sep 10;530(1):29-34.
    13. Nazarov PA, Kirsanov RS, Denisov SS, Khailova LS, Karakozova MV, Lyamzaev KG, Korshunova GA, Lukyanov KA, Kotova EA, Antonenko YN. Fluorescein Derivatives as Antibacterial Agents Acting via Membrane Depolarization. Biomolecules. 2020 Feb 15;10(2):309.
    14. Antonenko YN, Jędrzejczyk M, Rokitskaya TI, Khailova LS, Kotova EA, Huczyński A. Rate of translocation across lipid bilayer of triphenylphosphonium-linked salinomycin derivatives contributes significantly to their K+/H+ exchange activity on membranes. Bioelectrochemistry. 2022 Jun;145:108089.

Заседание диссовета при защите диссертации

Протокол заседания диссовета: Протокол № 18 от 20.10.2022 г.

Члены диссертационного совета, присутствовавшие на заседании при защите диссертации:

Присутствовали: д.б.н. Воденеев В.А. (председатель), д.б.н. Дерюгина А.В. (зам. председателя), к.б.н. Акинчиц Е.К. (секретарь), д.б.н. Ведунова М.В., д.м.н. Загайнова Е.В., д.б.н. Иванова И.П., д.ф.-м.н. Иванченко М.В., д.ф.-м.н. Каменский В.А., д.м.н. Масленникова А.В., д.б.н. Парин С.Б., д.б.н. Полевая С.А., д.б.н. Плескова С.Н.
Присутствовали дистанционно: д.б.н. Булычев А.А., д.б.н. Мухина И.В., д.м.н. Перетягин С.П.

Заключение диссовета

История

09.06.2022 - Текст диссертации размещён в сети Интернет

16.06.2022 - Диссертация принята к защите (протокол № 9)

26.10.2022 - Решение диссертационного совета по результатам защиты диссертации: присудить учёную степень кандидата наук, протокол: Протокол № 18 от 20.10.2022 г.

Присвоена степень кандидата наук