1. Афонников Дмитрий Аркадьевич, к.б.н., доц., в.н.с. лаборатории эволюционной биоинформатики и теоретической генетики ФГБНУ ФИЦ "Институт цитологии и генетики СО РАН" - отзыв
2. Канаков Олег Игоревич, д.ф.-м.н., проф. каф. теории колебаний и автоматического регулирования радиофизического факультета ФГАОУ ВО "Национальный исследовательский Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского" - отзыв
3. Кособрюхов Анатолий Александрович, д.б.н., с.н.с., руководитель группы экологии и физиологии фототрофных организмов Института фундаментальных проблем биологии РАН, ФИЦ НЦБИ РАН - отзыв
4. Тараканов Иван Германович, д.б.н., проф.. зав. каф. физиологии растений ФГБОУ ВО РГАУ-МСХА имени К.А. Тимирязева, Ларикова Ю.С., к.б.н., доц., доц. каф. физиологии растений ФГБОУ ВО РГАУ-МСХА имени К.А. Тимирязева - отзыв
5. Терентьев Василий Валерьевич, к.б.н., ведущий научный сотрудник лаборатории фотосинтетического окисления воды Института фундаментальных проблем биологии РАН ФИЦ "Пущинский научный центр биологических исследований РАН" - отзыв

Адрес: 127276, Москва, Ботаническая, 35

Список основных публикаций работников ведущей организации по теме диссертации в рецензируемых научных изданиях за последние 5 лет:
1. Rath J.R., Pandey J., Yadav R.M., Zamal M.Y., Ramachandran P., Mekala N.R., Allakhverdiev S.I, Subramanyam R. Temperature-induced reversible changes in photosynthesis efficiency and organization of thylakoid membranes from pea (Pisum sativum). Plant Physiology and Biochemistry. 2022. Т. 185. С. 144-154.
2. Hussain S., Ulhassan Z., Brestic M., Zivcak M., Zhou W., Allakhverdiev S.I., Yang X., Safdar M.E., Yang W., Liu W. Photosynthesis research under climate change. Photosynthesis Research. 2021. Т. 150. № 1. С. 5–19.
3. Chovancek E., Zivcak M., Brestic M., Hussain S., Allakhverdiev S.I. The different patterns of post-heat stress responses in wheat genotypes: the role of the transthylakoid proton gradient in efficient recovery of leaf photosynthetic capacity. Photosynthesis Research. 2021. Т. 150. № 1. С. 179-193.
4. Ibrahimova U., Zivcak M., Gasparovic K., Rastogi A., Allakhverdiev S.I., Yang X., Brestic M. Electron and proton transport in wheat exposed to salt stress: is the increase of the thylakoid membrane proton conductivity responsible for decreasing the photosynthetic activity in sensitive genotypes? Photosynthesis research. 2021. Т. 150. № 1. С. 195-211.
5. Pashkovskiy P., Kreslavski V.D., Ivanov Y., Ivanova A., Kartashov A., Shmarev A., Strokina V., Kuznetsov V.V., Allakhverdiev S.I. Influence of light of different spectral compositions on the growth, photosynthesis, and expression of light-dependent genes of scots pine seedlings. Cells. 2021. Т. 10. № 12. С. 3284.
6. Pashkovskiy P., Kreslavski V., Khudyakova A., Ashikhmin A., Bolshakov M., Kozhevnikova A., Kosobryukhov A., Kuznetsov V.V., Allakhverdiev S.I. Effect of high-intensity light on the photosynthetic activity, pigment content and expression of light-dependent genes of photomorphogenetic Solanum lycopersicum hp mutants. Plant Physiology and Biochemistry. 2021. Т. 167. С. 91-100.
7. Pan T., Liu M., Kreslavski V.D., Zharmukhamedov S.K., Nie C., Yu M., Kuznetsov V.V., Allakhverdiev S.I., Shabala S. Non-stomatal limitation of photosynthesis by soil salinity. Critical Reviews in Environmental Science and Technology. 2021. Т. 51. № 8. С. 791-825.
8. Sytar O., Zivcak M., Brestic M., Toutounchi P.M., Allakhverdiev S.I. Plasticity of the photosynthetic energy conversion and accumulation of metabolites in plants in response to light quality. Photosynthesis: Molecular Approaches to Solar Energy Conversion. Advances in Photosynthesis and Respiration. 2021. Т. 47. С. 533-563.
9. Landi M., Zivcak M., Sytar O., Brestic M., Allakhverdiev S.I. Plasticity of photosynthetic processes and the accumulation of secondary metabolites in plants in response to monochromatic light environments: A review. Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics. 2020. Т. 1861. № 2. С. 148131.
10. Hussain S., Pang T., Iqbal N., Shafiq I., Skalicky M., Brestic M., Safdar M.E., Mumtaz M., Ahmad A., Asghar M.A., Raza A., Allakhverdiev S.I., Wang Y., Wang X.C., Yang F., Yong T., Liu W., Yang W. Acclimation strategy and plasticity of different soybean genotypes in intercropping. Functional Plant Biology. 2020. Т. 47. № 7. С. 592-610.
11. Stetsenko L.A., Pashkovsky P.P., Voloshin R.A., Kreslavski V.D., Kuznetsov V. V., Allakhverdiev S.I. Role of anthocyanin and carotenoids in the adaptation of the photosynthetic apparatus of purple-and green-leaved cultivars of sweet basil (Ocimum basilicum) to high-intensity light. Photosynthetica. 2020. Т. 58. № 4. С. 890-901.
12. Zivcak M., Brestic M., Botyanszka L., Chen Y.-E., Allakhverdiev S.I. Phenotyping of isogenic chlorophyll-less bread and durum wheat mutant lines in relation to photoprotection and photosynthetic capacity. Photosynthesis research. 2019. Т. 139. № 1. С. 239-251.
13. Kreslavski V.D., Los D.A., Schmitt F.-J., Zharmukhamedov S.K., Kuznetsov V.V., Allakhverdiev S.I. The impact of the phytochromes on photosynthetic processes. Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics. 2018. Т. 1859. № 5. С. 400-408.
14. Shitov A.V., Terentyev V.V., Zharmukhamedov S.K., Rodionova M.V., Karacan M., Karacan N., Klimov V.V., Allakhverdiev S.I. Is carbonic anhydrase activity of photosystem II required for its maximum electron transport rate? Biochimica et Biophysica Acta – Bioenergetics. 2018. Т. 1859. № 4. С. 292-299.
15. Brestic M., Zivcak M., Hauptvogel P., Misheva S., Kocheva K., Yang X., Li X., Allakhverdiev S.I. Wheat plant selection for high yields entailed improvement of leaf anatomical and biochemical traits including tolerance to non-optimal temperature conditions. Photosynthesis Research. 2018. Т. 136. № 2. С. 245-255.

1. Ризниченко Галина Юрьевна - д.ф.-м.н., проф., профессор кафедры биофизики биологического факультета Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова» (г. Москва) (отзыв)
   
   

   Наименования отрасли науки, научной специальности, по которым оппонентом защищена диссертация:
   03.01.02 – Биофизика

   Список основных публикаций официального оппонента по теме диссертации в рецензируемых научных изданиях за последние 5 лет:
   1. Machine learning methods for assessing photosynthetic activity: environmental monitoring applications. Khruschev S.S., Plyusnina T.Y., Antal T.K., Pogosyan S.I., Riznichenko G.Y., Rubin A.B. Biophysical Reviews. 2022. Т. 14. С. 821–842.
   2. Molecular, Brownian, kinetic and stochastic models of the processes in photosynthetic membrane of green plants and microalgae. Riznichenko G.Y., Antal T.K., Belyaeva N.E., Khruschev S.S., Kovalenko I.B., Maslakov A.S., Plyusnina T.Y., Fedorov V.A., Rubin A.B. Biophysical Reviews. 2022. Т. 14. С. 985–1004.
   3. Динамика процессов в тилакоидных мембранах водорослей in vivo, изучаемая в моделях фотосистемы II и тилакоида по измерениям индукции флуоресценции. Беляева Н.Е., Булычев А.А., Пащенко В.З., Клементьев К.Е., Ермаченко П.А., Конюхов В.И., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Биофизика. 2022. Т. 67. № 5. С. 1-20.
   4. Simulating the interplay between the uptake of inorganic phosphate and the cell phosphate metabolism under phosphorus feast and famine conditions in Chlorella vulgaris. Plyusnina T.Y., Khruschev S., Fursova P.V., Solovchenko A.E., Antal T.K., Riznichenko G.Y., Rubin A.B. Cells. 2021. Т. 10. С. 3571.
   5. Модели фотосинтетического электронного транспорта. Ризниченко Г.Ю., Беляева Н.Е., Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Маслаков А.С., Антал Т.К., Горячев С.Н., Плюснина Т.Ю., Федоров В.А., Хрущев С.С., Рубин А.Б. Биофизика. 2020. Т. 65. № 5. С. 886-902.
   6. Gradual changes in the photosynthetic apparatus triggered by nitrogen depletion during microalgae cultivation in photobioreactor. Plyusnina T., Khruschev S., Degtereva N., Konyukhov I., Solovchenko A., Kouzmanova M., Goltsev V., Riznichenko G., Rubin A. Photosynthetica. 2020. Т. 58. С. 443-451.
   7. Analyzing both the fast and the slow phases of chlorophyll a fluorescence and P700 absorbance changes in dark-adapted and preilluminated pea leaves using a Thylakoid Membrane model. Belyaeva N.E., Bulychev A.A., Riznichenko G.Y. Rubin A.B. Photosynthesis Research. 2019. Т. 140. С. 1–19.
   8. Comparative analysis of plastocyanin-cytochrome f complex formation in higher plants, green algae and cyanobacteria. Fedorov V.A., Kovalenko I.B., Khruschev S.S., Ustinin D.M., Antal T.K., Riznichenko G.Y., Rubin A.B. 2019. Physiologia Plantarum. Т. 166. № 1. С. 320-335.
   9. Мониторинг фотосинтетической активности культуры микроводорослей Chlorella при истощении азота в среде. Плюснина Т.Ю., Хрущев С.С., Фролов А.Е., Дегтерева Н.С., Конюхов И.В., Погосян С.И., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Биофизика. 2019. Т. 64. № 3. С. 468-477.
   10. Multiparticle models of brownian dynamics for the description of photosynthetic electron transfer involving protein mobile carriers. Riznichenko G.Y, Kovalenko I.B. International Journal of Applied Research in Bioinformatics. 2019. Т. 9. № 1. С. 1-19.
   11. Simulation of chlorophyll fluorescence rise and decay kinetics, and P700-related absorbance changes by using a rule-based kinetic Monte-Carlo method. Antal T.K., Maslakov A., Yakovleva O.V., Krendeleva T.E., Riznichenko G.Y., Rubin A.B. Photosynthesis Research. 2018. Т. 138. №2. С. 191-206.

2. Борисова Мария Мансуровна, д.б.н., зам. директора по научной работе; ведущий научный сотрудник лаборатории фотосинтетического электронного транспорта с исполнением обязанностей заведующего лабораторией Института фундаментальных проблем биологии Российской академии наук (ИФПБ РАН) Обособленное подразделение Федерального государственного бюджетного учреждения науки «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук» (г. Пущино) (отзыв)
   
   

   Наименования отрасли науки, научной специальности, по которым оппонентом защищена диссертация:
   03.01.02 – Биофизика

   Список основных публикаций официального оппонента по теме диссертации в рецензируемых научных изданиях за последние 5 лет:
   1. Cooperative pathway of O2 reduction to H2O2 in chloroplast thylakoid membrane: new insight into the Mehler reaction. Ivanov B., Borisova-Mubarakshina M., Vilyanen D., Vetoshkina D., Kozuleva M. Biophysical Reviews. 2022. Т. 14. С. 857–869.
   2. Inhibition of plastoquinol oxidation at the cytochrome b6f complex by dinitrophenyl ether of iodonitrothymol (DNP-INT) depends on irradiance and H+ uptake by thylakoid membranes. Vilyanen D., Naydov I., Ivanov B., Borisova-Mubarakshina M., Kozuleva M. Biochimica et Biophysica Acta -Bioenergetics. 2022. Т. 1863. № 1. С. 148506.
   3. Photosynthetic antenna size regulation as an essential mechanism of higher plants acclimation to biotic and abiotic factors: the role of the chloroplast plastoquinone pool and hydrogen peroxide. Borisova-Mubarakshina M.M, Naydov I.A., Vetoshkina D.V., Kozuleva M.A., Vilyanen D.V., Rudenko N.N., Ivanov B.N. In book: Vegetation Index and Dynamics. 2021.
   4. Role of plant carbonic anhydrases under stress conditions. Rudenko N.N., Borisova-Mubarakshina M.M., Ignatova L.K., Fedorchuk T.P., Nadeeva-Zhurikova E.M., Ivanov B.N. Plant Stress Physiology. 2021. Т 4. № 1. С. 7-38.
   5. Advances in understanding the physiological role and locations of carbonic anhydrases in C3 plant cells. Rudenko N., Ignatova L., Nadeeva-Zhurikova E., Fedorchuk T., Ivanov B., Borisova-Mubarakshina M. Protoplasma. 2021. Т. 258. С. 249-262.
   6. Regulation of the size of photosystem II light harvesting antenna represents a universal mechanism of higher plant acclimation to stress conditions. Borisova-Mubarakshina M.M., Vetoshkina D.V., Naydov I.A., Rudenko N.N., Zhurikova E.M., Balashov N.V., Ignatova L.K., Fedorchuk T.P., Ivanov B.N. Functional Plant Biology. 2020. Т. 47. № 11. С. 959-969.
   7. Minimizing an electron flow to molecular oxygen in photosynthetic electron transfer chain: An evolutionary view. Kozuleva M.A., Ivanov B.N., Vetoshkina D.V., Borisova-Mubarakshina M.M. Frontiers in plant science. 2020. Т. 11. С. 211.
   8. The Increase in Adaptive Capacity to High Illumination of Barley Plants Colonized by Rhizobacteria P. putida BS3701. Vetoshkina D.V., Pozdnyakova-Filatova I.Y., Zhurikova E.M., Frolova A.A., Naydov I.A., Ivanov B.N., Borisova-Mubarakshina M.M. Applied Biochemistry and Microbiology. 2019. Т. 55. С. 173–181.
   9. Carbonic anhydrases in photosynthesizing cells of C3 higher plants. Ignatova L., Rudenko N., Zhurikova E., Borisova-Mubarakshina M., Ivanov B. Metabolites. 2019. Т. 9. № 4. С. 73.
   10. Сравнение изменений состояния фотосинтетической антенны арабидопсиса и ячменя при действии света разной интенсивности. Ветошкина Д.В., Козулева М.А., Терентьев В.В., Журикова Е.М., Борисова-Мубаракшина М.М., Иванов Б.Н. Биохимия. 2019. Т. 84, № 9. С. 1311 – 1321.
   11. Antioxidant and signaling functions of the plastoquinone pool in higher plants. Borisova‐Mubarakshina M.M., Vetoshkina D.V., Ivanov B.N. Physiologia Plantarum. 2019. Т. 166. № 1. С. 181-198.
   12. Oxidation of the plastoquinone pool in chloroplast thylakoid membranes by superoxide anion radicals. Borisova‐Mubarakshina M.M., Naydov I.A., Ivanov B.N. FEBS letters. 2018. Т. 592. № 19. С. 3221-3228.
   13. Antioxidant properties of plastoquinone and prospects of its practical application. Borisova-Mubarakshina M.M., Ivanov B.N.,Orekhova N.I., Osochuk S.S. Biophysics. 2018. Т. 63. № 6. С. 888-894

Протокол заседания диссовета: Протокол № 2 от 09.02.2023 г.

Члены диссертационного совета, присутствовавшие на заседании при защите диссертации:

Присутствовали очно: д.б.н. Воденеев В.А. (председатель), д.б.н. Дерюгина А.В. (зам. председателя), к.б.н. Акинчиц Е.К. (секретарь), д.б.н. Ведунова М.В., д.б.н. Иванова И.П., д.б.н. Мартусевич А.К., д.б.н. Парин С.Б., д.б.н. Плескова С.Н., д.б.н. Якимов В.Н.
Присутствовали дистанционно: д.б.н. Булычев А.А., д.ф.-м.н. Каменский В.А., д.б.н. Мухина И.В., д.б.н. Новиков В.В., д.м.н. Перетягин С.П.

Заключение диссовета

21.09.2022 - Текст диссертации размещён в сети Интернет

20.10.2022 - Диссертация принята к защите (протокол № 19)

13.02.2023 - Решение диссертационного совета по результатам защиты диссертации: присудить учёную степень кандидата наук, протокол: Протокол № 2 от 09.02.2023 г.